More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5612 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2203  GntR domain protein  33.76 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  36.03 
 
 		 247 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0962  GntR domain-containing protein  35.19 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.213599  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  36.77 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.91 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 238 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 226 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.08 
 
 		 230 aa  95.9  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.45 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.34 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.91 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.07 
 
 		 250 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 226 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.51 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.92 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.48 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 215 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  34.27 
 
 		 241 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  31.33 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  34.51 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  35.06 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  35.06 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  35.06 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  35.06 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.02 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.65 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  32.27 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  28.95 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 218 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  36.67 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  32.27 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  30.87 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  28.88 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.45 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  30 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.44 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.14 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.44 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  38.29 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.33 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  31.84 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  28.05 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  28.28 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  31.64 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.51 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  36.63 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  31.6 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  38.24 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  32.9 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.92 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  30.58 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  28.63 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  30.08 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.73 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  31.91 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  30.93 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  31.58 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>