More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5605 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  360  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  46.41 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 199 aa  87.8  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  31.06 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  25.84 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  28.48 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  39.56 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  39.56 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  39.56 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  33.13 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  25.43 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  38.81 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  37.68 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.35 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.35 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.35 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.35 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.35 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  36.11 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.74 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.8 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 207 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 207 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.62 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.62 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>