228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5337 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
319 aa  637    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  42.16 
 
 
319 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  38.03 
 
 
318 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  35.51 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  35.26 
 
 
312 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  35.35 
 
 
314 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  34.45 
 
 
330 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 
328 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 
328 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  33.77 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  33.77 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  33.66 
 
 
312 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  33.66 
 
 
319 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  33.44 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  31.68 
 
 
313 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  31.61 
 
 
307 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  31.58 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  27.18 
 
 
311 aa  109  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  28.16 
 
 
813 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  28.07 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  27.48 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1468  methionine synthase I  26.1 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799153  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27.51 
 
 
800 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  33.68 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  29.1 
 
 
811 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1771  methionine synthase I  25.48 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.0676063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  23.3 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  27.53 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2124  methionine synthase I  28.28 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0799  methionine synthase I  28.28 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.57 
 
 
605 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  24.6 
 
 
290 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1074  methionine synthase I  28.38 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.24236  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  25.34 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  26.39 
 
 
1196 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  25.28 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  30 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0626  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.66 
 
 
599 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.490063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.71 
 
 
610 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  28.07 
 
 
806 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  25.96 
 
 
819 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.87 
 
 
774 aa  60.1  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  26.55 
 
 
801 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  25 
 
 
804 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.97 
 
 
609 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  27.24 
 
 
804 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  27.55 
 
 
1224 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.43 
 
 
605 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  26.56 
 
 
804 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1195  methionine synthase  26.48 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.06 
 
 
610 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.88 
 
 
617 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  25.71 
 
 
1191 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  27.7 
 
 
1189 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0709  methionine synthase I  27.92 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  26.52 
 
 
629 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  28.41 
 
 
1227 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  30.43 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.16 
 
 
615 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  24.91 
 
 
1232 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  24.34 
 
 
434 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  24.56 
 
 
781 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  26.03 
 
 
780 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  27.14 
 
 
839 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  25.09 
 
 
841 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  23.84 
 
 
793 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  32.06 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  26.91 
 
 
804 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  25.27 
 
 
1249 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  27.14 
 
 
1224 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  28.16 
 
 
1176 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  27.19 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  29.82 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  26.57 
 
 
1225 aa  52.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  27.88 
 
 
312 aa  52.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  25.82 
 
 
1208 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  27.19 
 
 
841 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  26.67 
 
 
1180 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  27.27 
 
 
1197 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.79 
 
 
612 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  24.66 
 
 
1245 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  25.7 
 
 
1228 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  26.04 
 
 
1245 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1583  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.2 
 
 
637 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  25.35 
 
 
1254 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  25.71 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  27.46 
 
 
803 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  28.08 
 
 
802 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  27.86 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  25.17 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  25.17 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1961  methionine synthase  26.2 
 
 
1253 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23883  hitchhiker  0.00552664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  23.21 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  26.83 
 
 
1191 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  28.99 
 
 
818 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  23.95 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  26.83 
 
 
1191 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0102  homocysteine S-methyltransferase  25.36 
 
 
344 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  26.76 
 
 
310 aa  50.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  26.21 
 
 
1183 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>