More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4876 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
209 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  51.7 
 
 
207 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
192 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
215 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  44.1 
 
 
176 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 
225 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 
205 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 
208 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
202 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
210 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  46.4 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
209 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
220 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  41.78 
 
 
210 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  48.46 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  48.46 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
198 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  63.24 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  59.42 
 
 
257 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
218 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 
203 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
242 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  54.93 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
219 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  60.94 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  41.73 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  40.16 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  34.68 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  38.39 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  31.69 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  38.53 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  36.43 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>