More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4716 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  100 
 
 		 815 aa  1620    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  39.98 
 
 		 847 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  31.51 
 
 		 877 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  34.43 
 
 		 867 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  33.17 
 
 		 815 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  31.96 
 
 		 855 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  35.04 
 
 		 837 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  48.43 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  33.77 
 
 		 853 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  35.13 
 
 		 837 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  33.49 
 
 		 851 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  33.82 
 
 		 833 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  35.21 
 
 		 843 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  33.57 
 
 		 845 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  33.41 
 
 		 833 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  47.6 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  32.78 
 
 		 832 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  31.66 
 
 		 813 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  32.45 
 
 		 848 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  34.65 
 
 		 822 aa  379  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  32.74 
 
 		 818 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  34.08 
 
 		 896 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  33.45 
 
 		 833 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  31.62 
 
 		 864 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  34.93 
 
 		 840 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  33.76 
 
 		 868 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  33.64 
 
 		 868 aa  364  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  34.74 
 
 		 846 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  33.21 
 
 		 834 aa  363  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  42.86 
 
 		 763 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  32.1 
 
 		 902 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  34.15 
 
 		 861 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  57.93 
 
 		 352 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  31.75 
 
 		 871 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  34.85 
 
 		 825 aa  350  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  35.56 
 
 		 872 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  43.2 
 
 		 759 aa  345  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  42.83 
 
 		 766 aa  344  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  42.77 
 
 		 758 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  42.77 
 
 		 758 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  32.6 
 
 		 825 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  42.77 
 
 		 758 aa  341  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  32.35 
 
 		 863 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  32.08 
 
 		 646 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  56.45 
 
 		 306 aa  336  9e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  40.86 
 
 		 831 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  41.06 
 
 		 852 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  37.33 
 
 		 656 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  39.33 
 
 		 847 aa  323  9.000000000000001e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  32.48 
 
 		 817 aa  321  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  32.04 
 
 		 837 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  41.82 
 
 		 816 aa  318  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  58.31 
 
 		 313 aa  318  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1007  DNA polymerase LigD polymerase subunit  57.69 
 
 		 305 aa  317  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104732  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  59.51 
 
 		 313 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  56.95 
 
 		 313 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  39.36 
 
 		 797 aa  310  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  34.98 
 
 		 882 aa  300  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  34.95 
 
 		 658 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  43.7 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  34.84 
 
 		 684 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  35.1 
 
 		 927 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  33.55 
 
 		 866 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  38.05 
 
 		 828 aa  295  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  40.79 
 
 		 778 aa  293  9e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  32.73 
 
 		 865 aa  293  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  38.55 
 
 		 845 aa  293  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.68 
 
 		 303 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  34.95 
 
 		 683 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  37.02 
 
 		 846 aa  291  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  33.18 
 
 		 940 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  33.98 
 
 		 936 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  33.98 
 
 		 936 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  34.49 
 
 		 901 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  33.1 
 
 		 658 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  32.09 
 
 		 883 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  34.02 
 
 		 927 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  31.67 
 
 		 914 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  35.4 
 
 		 847 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  32.42 
 
 		 888 aa  277  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  32.63 
 
 		 939 aa  276  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  39.29 
 
 		 858 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  31.09 
 
 		 895 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  31.83 
 
 		 881 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  32.25 
 
 		 847 aa  275  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  33.84 
 
 		 644 aa  274  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  32.1 
 
 		 886 aa  270  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  31.86 
 
 		 930 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  48.84 
 
 		 302 aa  270  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  32.19 
 
 		 914 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  48.98 
 
 		 303 aa  267  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  31.54 
 
 		 913 aa  266  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3453  DNA primase, small subunit  48.96 
 
 		 301 aa  266  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  50.34 
 
 		 293 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  31.28 
 
 		 882 aa  266  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  34.85 
 
 		 651 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  33.16 
 
 		 651 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  30.57 
 
 		 900 aa  262  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  47.63 
 
 		 321 aa  261  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  30.3 
 
 		 911 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>