More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4629 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
430 aa  879    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  72.01 
 
 
420 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  73.44 
 
 
423 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  68.79 
 
 
474 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  70.69 
 
 
442 aa  594  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  69.43 
 
 
426 aa  588  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 
423 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  70.81 
 
 
422 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  69.36 
 
 
445 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  66.2 
 
 
435 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  71.81 
 
 
447 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  69.46 
 
 
453 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  68.4 
 
 
434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  67.61 
 
 
428 aa  568  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  67.39 
 
 
432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 
425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  67.38 
 
 
422 aa  558  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  66.04 
 
 
430 aa  561  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  66.51 
 
 
426 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 
429 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  68.71 
 
 
452 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  66.2 
 
 
432 aa  559  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 
435 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 
412 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  65.8 
 
 
427 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  67.51 
 
 
434 aa  551  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  71.6 
 
 
421 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  65.48 
 
 
440 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 
413 aa  521  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
415 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 
415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 
412 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 
415 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 
412 aa  504  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 
415 aa  494  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
415 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 
415 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 
418 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 
412 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 
417 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 
420 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
415 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 
413 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 
411 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 
412 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 
412 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.29 
 
 
416 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.88 
 
 
434 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 
417 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 
413 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  56.18 
 
 
429 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  56.6 
 
 
431 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.34 
 
 
434 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.34 
 
 
434 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 
415 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 
417 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
433 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  55.4 
 
 
437 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 
413 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 
413 aa  475  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 
414 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 
414 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
432 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 
423 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 
411 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  55.22 
 
 
427 aa  475  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 
417 aa  476  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 
440 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  58.96 
 
 
414 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 
439 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 
411 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 
413 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  54.84 
 
 
438 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 
425 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 
414 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  57.81 
 
 
433 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 
417 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 
412 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 
413 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 
427 aa  472  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 
413 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 
416 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 
417 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 
433 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 
434 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 
508 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 
413 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 
425 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  54.84 
 
 
438 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 
425 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 
413 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 
423 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 
416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  54.9 
 
 
415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 
424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  56.54 
 
 
424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  56.54 
 
 
434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 
417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>