More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4387 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.96 
 
 
267 aa  251  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  45.14 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
265 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
247 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  42.68 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
254 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
254 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
254 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
293 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
246 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
259 aa  151  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
261 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
262 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
248 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
248 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
254 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
270 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.16 
 
 
261 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
248 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
248 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  36.47 
 
 
269 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.6 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
255 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 
248 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
248 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
249 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
248 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
261 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
259 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.7 
 
 
252 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
246 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
258 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.49 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
269 aa  144  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  38.31 
 
 
260 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
249 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
274 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
249 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  38.55 
 
 
260 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
249 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
256 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
253 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
256 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.4 
 
 
251 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.46 
 
 
249 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
264 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
249 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.87 
 
 
250 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  36.59 
 
 
256 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 
264 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
246 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
251 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
247 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
257 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
248 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
251 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
248 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
257 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
248 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
258 aa  142  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
252 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
269 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
244 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  40.54 
 
 
258 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
264 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
255 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
263 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
257 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
261 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
251 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
250 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
246 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.14 
 
 
246 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
269 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
257 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  39.77 
 
 
258 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  39.77 
 
 
258 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  39.77 
 
 
258 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  39.77 
 
 
258 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  37.5 
 
 
269 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>