162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4219 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  100 
 
 
340 aa  676    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  39.94 
 
 
347 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  39.65 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  39.67 
 
 
370 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  40.22 
 
 
370 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  39.35 
 
 
370 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  41.05 
 
 
375 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  38.52 
 
 
370 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  43.99 
 
 
346 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  41.37 
 
 
368 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  39.07 
 
 
370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  38.81 
 
 
370 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  38.81 
 
 
370 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  39.89 
 
 
370 aa  258  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  38.8 
 
 
370 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  39.67 
 
 
370 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  40.22 
 
 
371 aa  255  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  40.22 
 
 
371 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  40.22 
 
 
365 aa  255  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  40 
 
 
368 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  40.17 
 
 
367 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  40.17 
 
 
367 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  39.45 
 
 
368 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  39.73 
 
 
368 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  40.77 
 
 
368 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  39.67 
 
 
368 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  41.42 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  39.18 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  38.9 
 
 
368 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  40.82 
 
 
365 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  41.48 
 
 
369 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  41.21 
 
 
365 aa  242  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  36.09 
 
 
364 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  38.57 
 
 
369 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  40.33 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  41.26 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  41.05 
 
 
368 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  41.38 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  40.7 
 
 
374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  41.49 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  36.96 
 
 
371 aa  232  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  39.42 
 
 
348 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  40.82 
 
 
348 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  39.65 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  38.55 
 
 
348 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  38.63 
 
 
368 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  34.62 
 
 
366 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  37.85 
 
 
365 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  40.18 
 
 
346 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  34.88 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  35.06 
 
 
349 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  40.82 
 
 
350 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  36.46 
 
 
368 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  36.29 
 
 
371 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  35.45 
 
 
631 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  40.82 
 
 
343 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  35.69 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  39.71 
 
 
640 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  35.16 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  42.17 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  36.16 
 
 
369 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  32.78 
 
 
373 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  36.21 
 
 
347 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  37.81 
 
 
373 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  35.03 
 
 
346 aa  207  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.36 
 
 
624 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  36.81 
 
 
351 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  41.49 
 
 
332 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.57 
 
 
350 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  40.23 
 
 
345 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  35.57 
 
 
348 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  42.11 
 
 
346 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  37.39 
 
 
334 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.86 
 
 
322 aa  202  8e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  35.65 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  37.18 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  32.21 
 
 
353 aa  198  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  35.17 
 
 
352 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  33.52 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  32.18 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  33.9 
 
 
358 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  34.46 
 
 
386 aa  196  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  35.45 
 
 
639 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  37.46 
 
 
374 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  33.6 
 
 
386 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  40.06 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  36.42 
 
 
331 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  31.99 
 
 
349 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  36.34 
 
 
351 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.26 
 
 
348 aa  185  9e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  31.9 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  32.09 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  36.76 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  36.13 
 
 
348 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  38.08 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  37.79 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  38.53 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  35 
 
 
343 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  35 
 
 
343 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  34.18 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>