26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3816 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
344 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.53 
 
 
348 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.53 
 
 
348 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.18 
 
 
348 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  39.94 
 
 
347 aa  239  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.91 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.91 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  41.83 
 
 
354 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  41.14 
 
 
346 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.46 
 
 
358 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  40.06 
 
 
355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  39.88 
 
 
344 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  42.01 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  40.59 
 
 
352 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  39.88 
 
 
360 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  44.44 
 
 
368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  39.22 
 
 
354 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  42.09 
 
 
353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  38.07 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.41 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.41 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.12 
 
 
358 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  41.02 
 
 
319 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  40.58 
 
 
302 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.94 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3482  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>