113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3785 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
444 aa  880    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  40.59 
 
 
423 aa  250  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  36.96 
 
 
403 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  39.3 
 
 
416 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 
400 aa  202  9e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  30.4 
 
 
397 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  33.16 
 
 
405 aa  193  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  37.05 
 
 
413 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 
400 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  31.64 
 
 
409 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  31.58 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 
406 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  27.48 
 
 
402 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  29.31 
 
 
404 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  30.83 
 
 
407 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  30.99 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  32.21 
 
 
413 aa  173  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 
405 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  30.58 
 
 
404 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  29.14 
 
 
406 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  33.67 
 
 
400 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  30.2 
 
 
428 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  32.52 
 
 
411 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  29.02 
 
 
419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  27.96 
 
 
413 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  28.72 
 
 
397 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  31.05 
 
 
424 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  27.16 
 
 
406 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  28.54 
 
 
405 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  28.76 
 
 
408 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  27.25 
 
 
411 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 
431 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 
411 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  31.33 
 
 
419 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  34.32 
 
 
412 aa  156  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  27.89 
 
 
400 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  35.33 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  27.75 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  32.04 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  29.06 
 
 
413 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 
408 aa  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  29.38 
 
 
404 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 
464 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  29.8 
 
 
411 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  30.79 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  25.67 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  30.79 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  33.57 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  27.85 
 
 
410 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  30.56 
 
 
417 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.87 
 
 
412 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  33.15 
 
 
448 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  31.31 
 
 
431 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  31.31 
 
 
431 aa  143  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  31.17 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  32.24 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  30.3 
 
 
429 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  27.09 
 
 
414 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  31.34 
 
 
403 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  29.4 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  24.88 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  31.07 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  33.21 
 
 
407 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  29.58 
 
 
448 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  22.96 
 
 
403 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  25.77 
 
 
379 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  31.32 
 
 
463 aa  124  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  28.68 
 
 
414 aa  124  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  23.18 
 
 
411 aa  123  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  29.78 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  32.13 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  25.77 
 
 
379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  26.8 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.82 
 
 
480 aa  116  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  30.09 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  28.87 
 
 
458 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  26.49 
 
 
397 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  29.29 
 
 
450 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  25.06 
 
 
410 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  26.54 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  29.9 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  32.38 
 
 
439 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  31.55 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  33.11 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  30.72 
 
 
399 aa  77  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  29.61 
 
 
389 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  30.65 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  32.72 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  32.72 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  25.67 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  34.27 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  31.41 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  31.87 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  33.17 
 
 
242 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  30.12 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  26.91 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
290 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>