126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3660 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  100 
 
 
133 aa  258  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  50.79 
 
 
254 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  50 
 
 
168 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.14 
 
 
369 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  49.21 
 
 
253 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  49.21 
 
 
253 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  52.34 
 
 
197 aa  123  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  51.91 
 
 
391 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.13 
 
 
365 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.13 
 
 
365 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.13 
 
 
365 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.13 
 
 
356 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  50.77 
 
 
370 aa  117  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  48.09 
 
 
137 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52 
 
 
378 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  48.06 
 
 
383 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  49.62 
 
 
197 aa  110  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  52.59 
 
 
440 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  44.53 
 
 
211 aa  107  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.24 
 
 
364 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  50.43 
 
 
412 aa  106  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  48.09 
 
 
363 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.12 
 
 
382 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.4 
 
 
378 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  38.35 
 
 
194 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  48.44 
 
 
197 aa  101  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  47.83 
 
 
452 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  47.37 
 
 
401 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  40.32 
 
 
198 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  48.12 
 
 
378 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  44.44 
 
 
198 aa  95.5  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  47.01 
 
 
411 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 
366 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  52.99 
 
 
402 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.83 
 
 
427 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  52.63 
 
 
81 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  41.27 
 
 
126 aa  92  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  39.1 
 
 
154 aa  90.1  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  43.41 
 
 
198 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  44.19 
 
 
322 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  38.28 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  41.22 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  37.78 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  33.86 
 
 
313 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  32.31 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  48.48 
 
 
412 aa  77  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  33.6 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  40.91 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  32.8 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  32.8 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  32.8 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  32.8 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  32.8 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  32.8 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  32.8 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  32.8 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  37.3 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  36.29 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  36.09 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  42.53 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  33.33 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  34.62 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  31.3 
 
 
209 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  28 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  28 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  35.77 
 
 
199 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  34.92 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  36.76 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  29.55 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  33.85 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  31.01 
 
 
376 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  43.02 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  32.33 
 
 
217 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  41.25 
 
 
220 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  43.14 
 
 
242 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  41.46 
 
 
217 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  24.81 
 
 
417 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  27.66 
 
 
388 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  24.81 
 
 
417 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  41.1 
 
 
215 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  40 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  38.16 
 
 
157 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1753  hypothetical protein  36.94 
 
 
207 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.792298  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4135  ribonuclease H  35.14 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  38.55 
 
 
223 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  28.26 
 
 
219 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  36.25 
 
 
223 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  34.18 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  42.68 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  29.21 
 
 
2805 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1509  hypothetical protein  37.97 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.600334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  36.59 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  44 
 
 
230 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000102134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  32.05 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  31.65 
 
 
170 aa  42.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  41.46 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>