191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3555 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  34.55 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.05 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  30.05 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  48.15 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  36.51 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  38.4 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  34.36 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  45.68 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  48.61 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  36.23 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  34.23 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 415 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 428 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  68.75 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.11 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  33.05 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  32.67 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
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NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 228 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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