More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3363 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 218 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  61.47 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  57.21 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.34 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  55.81 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  57.21 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  55.76 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.99 
 
 		 218 aa  228  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  56.81 
 
 		 215 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.5 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.81 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  52.09 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  54.13 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.58 
 
 		 214 aa  217  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.3 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.38 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  55.92 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.42 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.56 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.16 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  53.77 
 
 		 222 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  51.83 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  51.15 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.63 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.16 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.23 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  49.3 
 
 		 243 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  46.79 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  45.7 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.39 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  46.58 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.69 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  40.72 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  44 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  40.54 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.89 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.27 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  45.09 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  40.72 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  42.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  42.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  43.89 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.63 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  44.34 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.12 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.82 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  40.27 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.27 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.27 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  43.58 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.27 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  43.18 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  43.18 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>