More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3299 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  294  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1243  transcriptional regulator, MarR family  47.71 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0356088  normal  0.548993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  38.05 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  29.93 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  33.01 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  28.93 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  35.4 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 174 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.64 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  37.93 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.33 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  47.3 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  33.94 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  36.52 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>