More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3106 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  100 
 
 
641 aa  1271    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  41.36 
 
 
605 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.59 
 
 
599 aa  289  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.84 
 
 
595 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  36.64 
 
 
588 aa  282  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.41 
 
 
626 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  38.41 
 
 
651 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  35.94 
 
 
590 aa  277  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  37.29 
 
 
590 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  34.15 
 
 
595 aa  277  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  36.38 
 
 
618 aa  276  8e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.83 
 
 
599 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  33.91 
 
 
595 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  35.44 
 
 
652 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  35.57 
 
 
584 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  39.53 
 
 
651 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.58 
 
 
593 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.48 
 
 
571 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.48 
 
 
598 aa  271  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.48 
 
 
598 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.57 
 
 
660 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.48 
 
 
598 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.48 
 
 
598 aa  271  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.48 
 
 
598 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.64 
 
 
600 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.48 
 
 
598 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.71 
 
 
598 aa  270  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  34.92 
 
 
655 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.71 
 
 
598 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  33.54 
 
 
660 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  33.8 
 
 
600 aa  270  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.28 
 
 
604 aa  270  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  40.14 
 
 
636 aa  269  8.999999999999999e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  34.64 
 
 
651 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.48 
 
 
598 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  33.33 
 
 
660 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  35.82 
 
 
634 aa  268  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  35.33 
 
 
581 aa  267  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  37.35 
 
 
601 aa  267  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  29.71 
 
 
656 aa  267  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.02 
 
 
652 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  33.4 
 
 
663 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  33.69 
 
 
664 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  34.75 
 
 
663 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  35.33 
 
 
581 aa  266  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  35.33 
 
 
581 aa  266  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  35.33 
 
 
581 aa  266  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  35.33 
 
 
581 aa  266  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  35.33 
 
 
581 aa  266  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  35.33 
 
 
581 aa  266  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  39.01 
 
 
611 aa  266  8.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  33.74 
 
 
660 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  35.25 
 
 
582 aa  266  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  42.34 
 
 
601 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.31 
 
 
619 aa  264  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.23 
 
 
587 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  35.1 
 
 
584 aa  263  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  35.1 
 
 
581 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  35.1 
 
 
581 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.99 
 
 
582 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.99 
 
 
582 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.99 
 
 
582 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  30.67 
 
 
653 aa  263  8.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  35.27 
 
 
581 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  35.27 
 
 
581 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  35.27 
 
 
581 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  35.27 
 
 
581 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  35.27 
 
 
581 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  33.48 
 
 
585 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  37.03 
 
 
573 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  34.63 
 
 
614 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  37.88 
 
 
656 aa  261  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.83 
 
 
601 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  38.82 
 
 
667 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  40.2 
 
 
623 aa  260  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  36.32 
 
 
571 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  37.44 
 
 
641 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  34.18 
 
 
584 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  36.85 
 
 
639 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  33.95 
 
 
584 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  32.99 
 
 
666 aa  258  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  35.82 
 
 
581 aa  258  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.73 
 
 
588 aa  257  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  31.9 
 
 
703 aa  257  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.36 
 
 
583 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  37.92 
 
 
655 aa  257  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  29.91 
 
 
662 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  39.31 
 
 
642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  40.7 
 
 
669 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.27 
 
 
582 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.41 
 
 
613 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  32.33 
 
 
595 aa  254  5.000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  38.15 
 
 
671 aa  253  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.93 
 
 
604 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  37.5 
 
 
623 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  32.32 
 
 
595 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  35.65 
 
 
660 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  35.07 
 
 
575 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  37.24 
 
 
655 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  36.3 
 
 
583 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>