More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3082 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  100 
 
 
556 aa  1057    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.58 
 
 
565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  32.39 
 
 
566 aa  310  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  39.31 
 
 
605 aa  310  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.09 
 
 
567 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 
575 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 
580 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  35.02 
 
 
555 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  44.74 
 
 
557 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.83 
 
 
554 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  32.15 
 
 
557 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.1 
 
 
559 aa  297  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  40.41 
 
 
579 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 
573 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 
573 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  31.47 
 
 
570 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 
585 aa  289  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 
560 aa  289  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
567 aa  289  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 
554 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  40 
 
 
569 aa  286  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 
572 aa  286  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 
577 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  39.48 
 
 
579 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  38.76 
 
 
570 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  42.68 
 
 
578 aa  283  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.06 
 
 
579 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  38.57 
 
 
585 aa  283  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.63 
 
 
558 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  38.27 
 
 
549 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  38.27 
 
 
549 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  38.27 
 
 
549 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  38.27 
 
 
549 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  38.94 
 
 
558 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  38.27 
 
 
549 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  38.27 
 
 
549 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
580 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  31.89 
 
 
579 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  32.02 
 
 
579 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 
579 aa  281  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  38.27 
 
 
549 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 
560 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  31.85 
 
 
583 aa  280  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.02 
 
 
579 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  31.85 
 
 
583 aa  279  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  32.02 
 
 
579 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  31.85 
 
 
579 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  31.85 
 
 
579 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 
551 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 
559 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.63 
 
 
553 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 
574 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  36.47 
 
 
578 aa  276  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  31.67 
 
 
561 aa  276  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  30.73 
 
 
555 aa  276  8e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 
559 aa  276  9e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.49 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 
557 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  37.31 
 
 
580 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  38.43 
 
 
584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.92 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.92 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.92 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.92 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 
555 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  40.41 
 
 
584 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.56 
 
 
552 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  37.91 
 
 
549 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  38.28 
 
 
593 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 
561 aa  273  6e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  38.88 
 
 
523 aa  273  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 
552 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.2 
 
 
552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 
556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  28.72 
 
 
565 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  28.72 
 
 
565 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  35.91 
 
 
556 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 
556 aa  270  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.74 
 
 
552 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  38.32 
 
 
577 aa  269  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.32 
 
 
554 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  30.95 
 
 
553 aa  268  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  41.88 
 
 
574 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.38 
 
 
552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  35.15 
 
 
554 aa  267  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.28 
 
 
557 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 
586 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 
549 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.38 
 
 
552 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  29.01 
 
 
552 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 
549 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 
549 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 
549 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  31.55 
 
 
553 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 
589 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.49 
 
 
552 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  29.98 
 
 
553 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  39.65 
 
 
611 aa  264  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  33.2 
 
 
586 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>