47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3077 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  100 
 
 
487 aa  995    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  58.65 
 
 
469 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.87 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  34.41 
 
 
380 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  32.59 
 
 
323 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  33.44 
 
 
341 aa  140  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  35.28 
 
 
330 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  33.33 
 
 
329 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  33.33 
 
 
329 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  33.33 
 
 
329 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  32.81 
 
 
326 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  32.25 
 
 
870 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  29.74 
 
 
393 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  29.64 
 
 
439 aa  110  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  32.5 
 
 
491 aa  110  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  31.7 
 
 
469 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 
495 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  28.87 
 
 
359 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  30.43 
 
 
446 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  28.62 
 
 
346 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  29.74 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  28.91 
 
 
419 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  26.26 
 
 
469 aa  87.8  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  28.66 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  30.14 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  28.75 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  27.96 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  27.78 
 
 
361 aa  73.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.42 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  29.28 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  30.59 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  31.45 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  28.99 
 
 
456 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  24.08 
 
 
371 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  27.4 
 
 
465 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  24.32 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  26.67 
 
 
438 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  28.05 
 
 
350 aa  60.1  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  26.32 
 
 
465 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  25.61 
 
 
450 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  23.86 
 
 
655 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.11 
 
 
16311 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.18 
 
 
1009 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  22.5 
 
 
932 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.77 
 
 
1800 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 
3168 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  31.25 
 
 
8871 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>