204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2835 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  100 
 
 
90 aa  177  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  45.68 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  45.74 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  42.86 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  41.67 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 
81 aa  57.8  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  43.96 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  38.55 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  41.3 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  41.3 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  37.66 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  41.56 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  41.25 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  38.27 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  38.82 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  45 
 
 
88 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  40.26 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  37.18 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 
87 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  44 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  38.27 
 
 
86 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  39.76 
 
 
86 aa  53.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  40.45 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  37.35 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  41.67 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
89 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  38.96 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  38.96 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  38.96 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  43.04 
 
 
92 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  37.66 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  37.5 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 
92 aa  50.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  40.74 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  35.8 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  37.18 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368.1  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.5112799999999996e-45  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  36.47 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  39.76 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  36.14 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0094  ribosomal protein S20  38.67 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.25858e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  35.06 
 
 
90 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 
95 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  35 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  35.06 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>