23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2686 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2686  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 462 aa  889    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000948216  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5777  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.43 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.29 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  27 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.06 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.26 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.64 
 
 		 320 aa  50.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.9 
 
 		 318 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.81 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.37 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.68 
 
 		 216 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.28 
 
 		 314 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.21 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  28 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.87 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.09 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.94 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.6 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  28.15 
 
 		 356 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.54 
 
 		 330 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.94 
 
 		 339 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.83 
 
 		 314 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>