More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2663 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 
636 aa  1262    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  39.86 
 
 
559 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  39.35 
 
 
564 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  39.29 
 
 
562 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  46.77 
 
 
990 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  46.85 
 
 
908 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  46.72 
 
 
702 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  45.75 
 
 
1007 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  40.27 
 
 
497 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  40.08 
 
 
497 aa  347  5e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.39 
 
 
543 aa  345  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  45.72 
 
 
922 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.07 
 
 
494 aa  343  8e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  39.05 
 
 
490 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  42.33 
 
 
1113 aa  342  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  46.43 
 
 
457 aa  342  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  38.78 
 
 
492 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  45.94 
 
 
1041 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  39.53 
 
 
503 aa  339  9e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  40.64 
 
 
489 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  40.59 
 
 
496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  38.36 
 
 
483 aa  338  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  40.59 
 
 
496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  43.57 
 
 
503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  39.54 
 
 
495 aa  336  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.86 
 
 
531 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  39.84 
 
 
489 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  39.24 
 
 
496 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  35.87 
 
 
571 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  43.28 
 
 
1151 aa  333  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  43.28 
 
 
496 aa  333  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  44.67 
 
 
1427 aa  333  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  39.44 
 
 
489 aa  333  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  43.28 
 
 
496 aa  333  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  40.4 
 
 
490 aa  331  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  44.5 
 
 
959 aa  330  6e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  43.91 
 
 
1194 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  38.51 
 
 
492 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  43.91 
 
 
1334 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  41.67 
 
 
493 aa  325  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  39.64 
 
 
489 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  39.64 
 
 
489 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  39.24 
 
 
499 aa  323  6e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  39.64 
 
 
489 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  39.64 
 
 
489 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  39.64 
 
 
489 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  43.61 
 
 
1093 aa  323  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  37.63 
 
 
530 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  43.1 
 
 
1265 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  44.05 
 
 
1048 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  45.18 
 
 
717 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  42.03 
 
 
485 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  44.44 
 
 
944 aa  321  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  44.91 
 
 
1043 aa  321  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  42.03 
 
 
485 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  36.99 
 
 
487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  44.8 
 
 
1123 aa  320  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  45.06 
 
 
1117 aa  320  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  44 
 
 
952 aa  319  7.999999999999999e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  38.64 
 
 
483 aa  319  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  39.15 
 
 
491 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  40.66 
 
 
500 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  39.55 
 
 
497 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  37.04 
 
 
488 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  39.24 
 
 
489 aa  318  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  39.24 
 
 
489 aa  318  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  39.24 
 
 
489 aa  318  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  43 
 
 
1093 aa  317  4e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  38.83 
 
 
489 aa  317  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  43.47 
 
 
1058 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  38.77 
 
 
537 aa  317  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  43.22 
 
 
1024 aa  316  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  39.56 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  39.56 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  39 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  39.96 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  39.56 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  39.56 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  39.56 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  39.56 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  39.2 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  39.56 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  39.56 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.92 
 
 
489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  42.75 
 
 
1091 aa  315  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.99 
 
 
489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  41.72 
 
 
502 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  39.53 
 
 
493 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  41.65 
 
 
1022 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  38.63 
 
 
489 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  38.43 
 
 
489 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  36.1 
 
 
491 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  41.13 
 
 
485 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  40.64 
 
 
492 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  39.13 
 
 
489 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  39 
 
 
502 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  39 
 
 
502 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  38.43 
 
 
489 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  41.12 
 
 
483 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  40.69 
 
 
485 aa  312  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>