More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2425 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  100 
 
 
545 aa  1076    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  47.99 
 
 
542 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  48.71 
 
 
542 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  48.07 
 
 
537 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  49.6 
 
 
538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  46.48 
 
 
535 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  38.96 
 
 
569 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  39.78 
 
 
541 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  35.29 
 
 
574 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  39.6 
 
 
530 aa  279  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  36.51 
 
 
573 aa  276  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  38.11 
 
 
556 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  36.65 
 
 
569 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  34.85 
 
 
616 aa  263  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  39.5 
 
 
544 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  35.93 
 
 
564 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  36.51 
 
 
532 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  35.71 
 
 
543 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  38.76 
 
 
548 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  38.76 
 
 
548 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  38.76 
 
 
548 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  34.01 
 
 
606 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  35.42 
 
 
620 aa  249  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  35.21 
 
 
576 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  35.09 
 
 
564 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  35.85 
 
 
543 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  35.85 
 
 
583 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  35.85 
 
 
583 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  33.51 
 
 
573 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  33.09 
 
 
603 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  34.01 
 
 
546 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  32.65 
 
 
583 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  32.91 
 
 
608 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  31.61 
 
 
553 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  33.64 
 
 
553 aa  230  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  32.37 
 
 
613 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  33.46 
 
 
569 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  32.32 
 
 
550 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  33.45 
 
 
576 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  32.64 
 
 
527 aa  227  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  32.17 
 
 
585 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.48 
 
 
560 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  33.16 
 
 
583 aa  223  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  32.49 
 
 
548 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  32.98 
 
 
583 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  37.34 
 
 
536 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  30.89 
 
 
560 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  32.98 
 
 
580 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  32.99 
 
 
580 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  30.12 
 
 
560 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  35.04 
 
 
579 aa  217  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  36.88 
 
 
547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  32.78 
 
 
544 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  34.44 
 
 
601 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  35.78 
 
 
574 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  31.99 
 
 
552 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  36.38 
 
 
553 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  31.33 
 
 
557 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
552 aa  210  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.61 
 
 
565 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.5 
 
 
556 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  34.66 
 
 
549 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  33.45 
 
 
560 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.21 
 
 
556 aa  203  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  33.15 
 
 
575 aa  203  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  34.22 
 
 
550 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  35.39 
 
 
568 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  31.34 
 
 
619 aa  201  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  31.66 
 
 
565 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  33.64 
 
 
545 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  36.76 
 
 
556 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
582 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  33.69 
 
 
550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  31.17 
 
 
589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.65 
 
 
596 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  36.67 
 
 
532 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  33.09 
 
 
565 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.29 
 
 
564 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.84 
 
 
555 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  36.77 
 
 
536 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  35.05 
 
 
522 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  34.62 
 
 
538 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  34.67 
 
 
537 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  32.6 
 
 
549 aa  193  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  32.74 
 
 
543 aa  192  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.8 
 
 
544 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 
512 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.64 
 
 
584 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.69 
 
 
541 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.88 
 
 
546 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.94 
 
 
543 aa  183  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  29.24 
 
 
563 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  28.62 
 
 
568 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  34.92 
 
 
532 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.25 
 
 
543 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  29.06 
 
 
563 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  29.26 
 
 
563 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  33.04 
 
 
543 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  31.24 
 
 
551 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.02 
 
 
580 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>