More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2417 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 998 aa  1875    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 960 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 952 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  36.5 
 
 		 946 aa  348  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  40.88 
 
 		 974 aa  339  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  38.34 
 
 		 951 aa  338  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 948 aa  326  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 		 940 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  39.78 
 
 		 943 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  34.73 
 
 		 932 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 		 947 aa  219  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 1104 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.42 
 
 		 947 aa  173  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  44.73 
 
 		 855 aa  158  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 877 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 1015 aa  108  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 937 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 937 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 937 aa  107  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.41 
 
 		 923 aa  104  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  38.72 
 
 		 939 aa  102  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 908 aa  101  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 925 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  37.57 
 
 		 995 aa  95.5  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 879 aa  95.1  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 881 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 881 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 876 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 994 aa  94.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 923 aa  92.8  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 		 920 aa  92.8  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.2 
 
 		 917 aa  90.9  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 929 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  37.81 
 
 		 894 aa  90.9  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  30.79 
 
 		 936 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.6 
 
 		 998 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  34.63 
 
 		 925 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  36.88 
 
 		 940 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 921 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 910 aa  85.9  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 921 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 921 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  39.06 
 
 		 928 aa  85.5  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  42.02 
 
 		 927 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  29.31 
 
 		 943 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.42 
 
 		 918 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  36.48 
 
 		 913 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 905 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 938 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  37.31 
 
 		 977 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  36.12 
 
 		 928 aa  81.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  36.9 
 
 		 921 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  40.6 
 
 		 189 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  36.76 
 
 		 893 aa  79.7  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  36.76 
 
 		 923 aa  80.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.66 
 
 		 913 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 894 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  39.89 
 
 		 919 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  37.34 
 
 		 929 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 909 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.79 
 
 		 1029 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 723 aa  78.2  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 1000 aa  77.8  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  37.86 
 
 		 930 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 919 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  30.65 
 
 		 961 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  37.94 
 
 		 1074 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 911 aa  75.5  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  41.86 
 
 		 929 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  33.09 
 
 		 934 aa  74.7  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  38.42 
 
 		 336 aa  73.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 931 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 904 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 910 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  38.8 
 
 		 913 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 889 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  43.33 
 
 		 892 aa  72.4  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.12 
 
 		 884 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 956 aa  72.4  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  37.76 
 
 		 927 aa  71.6  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.99 
 
 		 981 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  35.59 
 
 		 955 aa  70.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.82 
 
 		 713 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 1193 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  34.98 
 
 		 919 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 900 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.12 
 
 		 1089 aa  69.3  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  42.75 
 
 		 923 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 956 aa  68.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.25 
 
 		 1271 aa  68.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.05 
 
 		 1126 aa  67.8  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  36.36 
 
 		 884 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 1022 aa  67.4  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 919 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.06 
 
 		 919 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  22.49 
 
 		 1147 aa  67.4  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 		 928 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 965 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 1190 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>