229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2394 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
235 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  41.26 
 
 
216 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 
243 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 
244 aa  109  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
232 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 
234 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
254 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 
227 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
247 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 
221 aa  99  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
283 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  33.33 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  33.05 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
254 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  32.88 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  31.56 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
225 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
229 aa  89  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
195 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 
240 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
241 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  28.32 
 
 
242 aa  79  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  33.87 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  30.3 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  37.6 
 
 
250 aa  71.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  37.29 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.38 
 
 
196 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  41.18 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 
195 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  26.51 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
195 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 
307 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30.63 
 
 
199 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
218 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
209 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
197 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 
200 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  28.37 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
333 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  35.35 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.21 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
193 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>