More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2276 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  48.51 
 
 
927 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
928 aa  1765    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  46.95 
 
 
892 aa  582  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  35.73 
 
 
928 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.66 
 
 
884 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  35.5 
 
 
923 aa  346  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.21 
 
 
955 aa  338  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.12 
 
 
919 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 
909 aa  333  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.25 
 
 
923 aa  313  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.91 
 
 
961 aa  300  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
889 aa  298  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 
911 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  35.13 
 
 
934 aa  290  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 
923 aa  277  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  35.99 
 
 
913 aa  271  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.37 
 
 
938 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  31.75 
 
 
913 aa  254  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 
905 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  33.84 
 
 
919 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 
903 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.8 
 
 
879 aa  230  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 
940 aa  223  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 
925 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  40.64 
 
 
953 aa  220  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  38.69 
 
 
922 aa  213  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  40.25 
 
 
928 aa  211  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  41.09 
 
 
946 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 
918 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 
920 aa  194  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.93 
 
 
929 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.4 
 
 
923 aa  187  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
937 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  41.15 
 
 
937 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  40.89 
 
 
937 aa  183  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  38.51 
 
 
936 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 
915 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 
927 aa  157  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 
1064 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 
959 aa  147  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  42.04 
 
 
240 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.81 
 
 
917 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  39.82 
 
 
940 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  49.66 
 
 
929 aa  125  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  37.02 
 
 
930 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 
904 aa  122  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.64 
 
 
884 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 
995 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 
916 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 
916 aa  108  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  33.62 
 
 
900 aa  107  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.26 
 
 
1055 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.75 
 
 
921 aa  104  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
921 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.2 
 
 
921 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
881 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
881 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
876 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 
894 aa  98.6  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 
894 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  42.28 
 
 
893 aa  91.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  42.36 
 
 
189 aa  91.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 
913 aa  91.3  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 
910 aa  90.9  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  33.04 
 
 
919 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 
910 aa  89.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  30.43 
 
 
921 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 
835 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.19 
 
 
1271 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.27 
 
 
1034 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  31.32 
 
 
929 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.68 
 
 
1015 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
951 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.9 
 
 
1422 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 
946 aa  81.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.34 
 
 
977 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.22 
 
 
1005 aa  80.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
236 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
1000 aa  79.7  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 
919 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
1048 aa  78.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.43 
 
 
1666 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 
932 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
919 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 
919 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.02 
 
 
947 aa  77.8  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.97 
 
 
1175 aa  77.4  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  28.61 
 
 
1133 aa  77.4  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.35 
 
 
1075 aa  77  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 
967 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
973 aa  77  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.34 
 
 
1067 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 
954 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
1402 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 
983 aa  75.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 
997 aa  75.1  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  42.97 
 
 
927 aa  75.1  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 
992 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.52 
 
 
947 aa  74.7  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 
900 aa  74.7  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>