57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2150 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 289 aa  565  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  32.83 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  38.66 
 
 		 318 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  38.06 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  26.34 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  32.7 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  35.53 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  33.06 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  33.21 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  29.5 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  29.48 
 
 		 276 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  26.62 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  35.74 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  29.92 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  29.6 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  30.47 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.94 
 
 		 352 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  31.99 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  31.82 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  25.74 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  34.36 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.63 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  28.74 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  28.63 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.63 
 
 		 316 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 316 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  26.62 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  32.17 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  28.68 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  31.51 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  28.26 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  24.51 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  29.5 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1864  PaaX family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0391  putative transcriptional regulator, PaaX family  43.4 
 
 		 154 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  28.5 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>