More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2099 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  32.49 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 227 aa  99  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.51 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  28.1 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 223 aa  88.6  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 217 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 226 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.53 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 224 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  30.39 
 
 		 224 aa  85.5  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>