More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2011 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2011  integrase family protein  100 
 
 		 442 aa  881    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  80.42 
 
 		 452 aa  685    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1759  integrase family protein  33.19 
 
 		 504 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369791  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.07 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  31.53 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.33 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.06 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  24.92 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  23.53 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  23.53 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  23.53 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  28.3 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  30.08 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.59 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.84 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.66 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  28.42 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  28.42 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.71 
 
 		 277 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  26.65 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.4 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.45 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.24 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  30.46 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  23.28 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.76 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  22.48 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  25.6 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.01 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.54 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  24.18 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  23.34 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  30 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  29.02 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  23.08 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  21.75 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.88 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.09 
 
 		 374 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.09 
 
 		 374 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  29.34 
 
 		 381 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  23.08 
 
 		 431 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  23.08 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.42 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  24.69 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  22.96 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  24.74 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.88 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.87 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  27.34 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  34.64 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.94 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  29.18 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.56 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.27 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.73 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  26.11 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  22.99 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.24 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.2 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  28.49 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  29.22 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.96 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  27.32 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  30.56 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  23.52 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  27.44 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  21.93 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.16 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  20.53 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.76 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  31.58 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  23.65 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.36 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.37 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.91 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  28.19 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.55 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0272  phage integrase  31.65 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000104155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  27.46 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  25.4 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.74 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  26.4 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.25 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.53 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.2 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.76 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  21.21 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  31.9 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.24 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  31.67 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>