More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1860 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  100 
 
 
341 aa  661    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  47.54 
 
 
340 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  48.84 
 
 
344 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  44.14 
 
 
344 aa  258  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  41.57 
 
 
344 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  47.57 
 
 
309 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  48.06 
 
 
309 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  41.61 
 
 
306 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  43.67 
 
 
334 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  45.33 
 
 
348 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  46.53 
 
 
308 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  45.51 
 
 
323 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  45.51 
 
 
313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  42.49 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  49.35 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  45.39 
 
 
326 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.13 
 
 
336 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 
316 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  43.85 
 
 
331 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  47.3 
 
 
324 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  43.63 
 
 
328 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  41.52 
 
 
335 aa  228  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  39.09 
 
 
309 aa  228  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  43.63 
 
 
309 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  46.96 
 
 
307 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  42.49 
 
 
325 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  42.39 
 
 
309 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  42.07 
 
 
309 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  42.39 
 
 
309 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  45.08 
 
 
307 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  41.42 
 
 
309 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  45.51 
 
 
309 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 
309 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  44.16 
 
 
309 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  42.9 
 
 
337 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  41.04 
 
 
309 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  42.16 
 
 
309 aa  222  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  44.78 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  43.09 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  40.69 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  46.79 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  44.04 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  45.15 
 
 
359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  42.39 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  42.58 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  44.3 
 
 
311 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  43.04 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 
306 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 
321 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  41.61 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  39.1 
 
 
308 aa  213  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  44.98 
 
 
309 aa  212  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  40.49 
 
 
345 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  43.62 
 
 
309 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  42.23 
 
 
311 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  44.9 
 
 
307 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  40.84 
 
 
314 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 
307 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  41.47 
 
 
306 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  43.35 
 
 
308 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  39.25 
 
 
317 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  43.77 
 
 
311 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  39.06 
 
 
341 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  40.25 
 
 
341 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  38.63 
 
 
341 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  41.42 
 
 
323 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  45.25 
 
 
313 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  37.63 
 
 
307 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  40.69 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  40.69 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  38.21 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.21 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  35.4 
 
 
379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  44.3 
 
 
365 aa  199  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  38.54 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 
316 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  43.04 
 
 
307 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  41.78 
 
 
307 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  41.31 
 
 
307 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  36.96 
 
 
306 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  37.62 
 
 
315 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.96 
 
 
380 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  41.35 
 
 
307 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  41.03 
 
 
307 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  41.35 
 
 
307 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  41.35 
 
 
307 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  41.35 
 
 
307 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  41.35 
 
 
307 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  41.35 
 
 
307 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  41.04 
 
 
307 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  41.35 
 
 
307 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  40.66 
 
 
307 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  41.61 
 
 
307 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.44 
 
 
380 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  40.63 
 
 
308 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  37.46 
 
 
306 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>