More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1764 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  100 
 
 		 274 aa  547  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  44.63 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  43.33 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  44.08 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  43.67 
 
 		 289 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  43.67 
 
 		 289 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  36.4 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  40.66 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  41.53 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  41.7 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  38.74 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  37.98 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  42.61 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  38.4 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  39.43 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  39.11 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  36.21 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  36.29 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  35.46 
 
 		 381 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  37.45 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  38.7 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  37.6 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  36.4 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  37.75 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  36.53 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  38.58 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  36.9 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  37.04 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.66 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  34.1 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  32.21 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  37.31 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.98 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  34.08 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  36.19 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  31.38 
 
 		 227 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  37.29 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  34.21 
 
 		 371 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  34.43 
 
 		 487 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  34.43 
 
 		 487 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.04 
 
 		 342 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  37.1 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.04 
 
 		 342 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  29.84 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  30.41 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.87 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.56 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  34.73 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  29.38 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  28.5 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  28.5 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  28.38 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  30.73 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  29.1 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  31.94 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  30.73 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  30.21 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  35.23 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  32.3 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  29.23 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  39.42 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  29.52 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  29.27 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.79 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  32.18 
 
 		 541 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  35.71 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  35.22 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0964  TPR repeat-containing protein  64.44 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  29.38 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  33.5 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  40.15 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  29.87 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  27.89 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.36 
 
 		 519 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  38.19 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.96 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  36.36 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  31.41 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  39.74 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.15 
 
 		 554 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  40.78 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.64 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  31.43 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  32.54 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  34.16 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  29.85 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0788  hypothetical protein  54 
 
 		 160 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.449202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  30 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  29.78 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  29.78 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  36.99 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  30 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  28.7 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  28.35 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  31.72 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>