218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1729 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
681 aa  1258    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.3 
 
 
837 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  46.98 
 
 
792 aa  247  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  44.75 
 
 
778 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  49.48 
 
 
376 aa  239  9e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  45.45 
 
 
776 aa  236  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  45.15 
 
 
784 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  37.4 
 
 
743 aa  220  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  42.39 
 
 
593 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.21 
 
 
553 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  48.56 
 
 
554 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  44.79 
 
 
558 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  40.27 
 
 
551 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  45.6 
 
 
579 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  41.35 
 
 
1129 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  48.08 
 
 
569 aa  205  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.09 
 
 
556 aa  204  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  41.64 
 
 
835 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.18 
 
 
561 aa  200  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  40.4 
 
 
477 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  40.82 
 
 
1848 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.14 
 
 
563 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.71 
 
 
706 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.68 
 
 
1919 aa  195  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.95 
 
 
821 aa  194  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.47 
 
 
818 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  41.45 
 
 
577 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  42.22 
 
 
553 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  45.33 
 
 
560 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.48 
 
 
555 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  34.11 
 
 
911 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.15 
 
 
570 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.94 
 
 
417 aa  187  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.1 
 
 
567 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  48.02 
 
 
546 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.76 
 
 
555 aa  183  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  38.46 
 
 
389 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  39.78 
 
 
443 aa  178  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  43.95 
 
 
717 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  34.13 
 
 
461 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  41.01 
 
 
2082 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  40.86 
 
 
554 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.41 
 
 
726 aa  171  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.85 
 
 
1679 aa  171  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  43.13 
 
 
714 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  39.28 
 
 
403 aa  167  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.72 
 
 
469 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  33.43 
 
 
461 aa  164  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  35.17 
 
 
363 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  35.17 
 
 
363 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  40.51 
 
 
558 aa  160  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  40.59 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  34.04 
 
 
449 aa  148  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  39.47 
 
 
624 aa  147  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  35.47 
 
 
1222 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  34.6 
 
 
638 aa  146  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.6 
 
 
941 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  32.12 
 
 
807 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  38.77 
 
 
737 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  35.17 
 
 
1207 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.24 
 
 
817 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  36.24 
 
 
1187 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.47 
 
 
787 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  37.59 
 
 
547 aa  127  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.67 
 
 
454 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.73 
 
 
1147 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.73 
 
 
810 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  38.73 
 
 
900 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  38.08 
 
 
618 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
745 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.04 
 
 
692 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  38.29 
 
 
602 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  30.52 
 
 
341 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  35.15 
 
 
450 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  34.63 
 
 
544 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.17 
 
 
535 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  31.96 
 
 
418 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.05 
 
 
1126 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  32.73 
 
 
454 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.12 
 
 
921 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  36.15 
 
 
558 aa  100  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  31.71 
 
 
328 aa  100  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  29.88 
 
 
547 aa  100  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  42.86 
 
 
1426 aa  100  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  30.45 
 
 
597 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  38.91 
 
 
375 aa  97.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  32.83 
 
 
575 aa  97.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  31.56 
 
 
307 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  26.33 
 
 
499 aa  91.3  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  29.66 
 
 
396 aa  91.3  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  30.58 
 
 
728 aa  90.9  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  30.24 
 
 
590 aa  90.1  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  28.74 
 
 
1312 aa  88.6  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.7 
 
 
643 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  28.03 
 
 
727 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  31.61 
 
 
643 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  31.91 
 
 
332 aa  86.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  49.21 
 
 
209 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  32.26 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  29.21 
 
 
371 aa  83.2  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>