More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1680 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 161 aa  320  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  59.03 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  56.41 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  54.79 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  56.25 
 
 		 156 aa  156  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  51.37 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  53.47 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  59.03 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  53.47 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  51.03 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  51.77 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  48.61 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  48.61 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  51.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  52.41 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  55.86 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  48.61 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  50.35 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 175 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  48.61 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  53.47 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  46.43 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  47.62 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  46.62 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  46.26 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  45.89 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  45.83 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  44.22 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  51.24 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  44.22 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  45.58 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  45.83 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  40.74 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  42.47 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.06 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  43.06 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  43.06 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  45.07 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  44.83 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  42.38 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  43.84 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  41.26 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  43.15 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  40.85 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  44.83 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  43.15 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  43.15 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>