185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1641 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 416 aa  783    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 564 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  35.58 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.06 
 
 		 525 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  32.2 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  38.32 
 
 		 518 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  35.17 
 
 		 705 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.99 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  29.63 
 
 		 648 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 659 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  29.88 
 
 		 616 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  32.34 
 
 		 644 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.53 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  30.84 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  30.75 
 
 		 553 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  31.23 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  32.05 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.03 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.81 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0495  CdaR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  41.82 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  25.96 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.96 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  30.82 
 
 		 741 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.1 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  25.96 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  25.96 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.96 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.97 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  29.83 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.31 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  25.46 
 
 		 616 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  27.65 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.96 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.58 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.61 
 
 		 601 aa  59.7  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32.65 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.59 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  28.21 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.71 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.97 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.97 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.97 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.97 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.97 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  55.93 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  25.83 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  41.89 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.39 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.39 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  24.62 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  29.39 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  36.62 
 
 		 486 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.04 
 
 		 509 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  20.83 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  19 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  31.03 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  27.16 
 
 		 627 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  40.45 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.06 
 
 		 459 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  27.22 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 537 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  33.93 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.4 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 597 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  29.92 
 
 		 454 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  35.38 
 
 		 518 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  37.76 
 
 		 557 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  25.53 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  25.81 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.18 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.83 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  38.64 
 
 		 543 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  38.03 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.03 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  34.4 
 
 		 554 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  26.21 
 
 		 488 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  29.74 
 
 		 537 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  35.14 
 
 		 518 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 364 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 488 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  44.12 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  46.77 
 
 		 442 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  30.99 
 
 		 520 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>