75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1562 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  46.28 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 114 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  27.19 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  37.93 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  31.93 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  35.87 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  31.13 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  26.14 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 121 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  42.17 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  24.14 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  34 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  28 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  24.1 
 
 		 110 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  27.16 
 
 		 111 aa  45.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 226 aa  44.7  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  31.03 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  22.95 
 
 		 305 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  29.47 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0943  transcriptional regulator, PadR-like family  26.32 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 115 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 108 aa  42  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 212 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 182 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 179 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  22.61 
 
 		 116 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  29.9 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  28.46 
 
 		 227 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  24 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  45.16 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>