88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1560 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  587  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  57.14 
 
 
306 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  57.79 
 
 
270 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1712  hypothetical protein  56.12 
 
 
237 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2517  hypothetical protein  47.31 
 
 
315 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  39.38 
 
 
285 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  108  8e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  32.96 
 
 
311 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  30.88 
 
 
286 aa  82.4  8e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  29.93 
 
 
289 aa  80.9  2e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  32.87 
 
 
285 aa  81.3  2e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  31.47 
 
 
285 aa  78.6  1e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  34.94 
 
 
259 aa  70.9  2e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  31.77 
 
 
318 aa  71.2  2e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  33.04 
 
 
242 aa  70.1  5e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  32.97 
 
 
357 aa  67  4e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  33.2 
 
 
320 aa  64.3  2e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  30.04 
 
 
294 aa  64.7  2e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  27.82 
 
 
294 aa  61.2  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  31.84 
 
 
424 aa  61.6  2e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  38.56 
 
 
207 aa  61.6  2e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  29.05 
 
 
289 aa  60.5  3e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  26.57 
 
 
374 aa  60.1  4e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  30.51 
 
 
335 aa  59.7  6e-08  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  27.78 
 
 
320 aa  59.7  6e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  29.71 
 
 
328 aa  59.3  7e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  35.12 
 
 
330 aa  59.3  9e-08  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  27.88 
 
 
306 aa  57.8  2e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  34.42 
 
 
305 aa  57.4  3e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  27.61 
 
 
351 aa  56.6  6e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  28.36 
 
 
310 aa  55.8  9e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  31.29 
 
 
303 aa  55.5  1e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  29.75 
 
 
289 aa  55.5  1e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  54.7  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  29.29 
 
 
307 aa  54.7  2e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  29.06 
 
 
307 aa  53.9  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  28.43 
 
 
304 aa  53.9  4e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  28.52 
 
 
293 aa  53.1  5e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  29.25 
 
 
283 aa  52  1e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  28.28 
 
 
277 aa  51.2  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  30.88 
 
 
278 aa  51.2  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  32.53 
 
 
303 aa  51.2  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22570  hypothetical protein  31 
 
 
237 aa  51.6  2e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  30.59 
 
 
279 aa  50.8  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  3.00083e-06 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  27.43 
 
 
301 aa  50.4  4e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3561  hypothetical protein  32.67 
 
 
173 aa  49.7  5e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  29.08 
 
 
295 aa  49.7  6e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6926e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  27.27 
 
 
205 aa  49.7  7e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  39.58 
 
 
148 aa  49.3  9e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  28 
 
 
298 aa  48.9  9e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  41.24 
 
 
290 aa  48.9  9e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1182  hypothetical protein  46.3 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  29.33 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  28.24 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  27.46 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  27.46 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  38.57 
 
 
122 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  4.22818e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  38.57 
 
 
122 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  32.39 
 
 
316 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  28.88 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  27.47 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4255  hypothetical protein  30.46 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  32.39 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  27.49 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  28.64 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  30.52 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  30.52 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  28.39 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  29.86 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2824  protein of unknown function DUF559  38.81 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0136609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  28.65 
 
 
379 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  28.51 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  27.94 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  35.16 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  29.29 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.65 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.65 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  27.08 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  25.73 
 
 
329 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  25.82 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  28.43 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  27.63 
 
 
280 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  32.17 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  32.31 
 
 
773 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>