263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1358 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  124  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  54.39 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  58.18 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  52.63 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  55.36 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  56.36 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  51.79 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  51.79 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  45.45 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 57 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 57 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3891  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000029695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0444  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000247564  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000049489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  56 
 
 		 51 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>