More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1346 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  100 
 
 		 395 aa  713    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  63.33 
 
 		 214 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  60.66 
 
 		 221 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 278 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  60.95 
 
 		 220 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  61.95 
 
 		 270 aa  272  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  59.9 
 
 		 341 aa  272  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  58.57 
 
 		 218 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  60.29 
 
 		 219 aa  269  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 217 aa  269  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  60.49 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 287 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 287 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 287 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 278 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  54.23 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 218 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  54.23 
 
 		 288 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 220 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  60.98 
 
 		 272 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 268 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 274 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 221 aa  265  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  52.96 
 
 		 282 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 219 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 217 aa  265  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 218 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  59.62 
 
 		 286 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2149  SSU ribosomal protein S3P  63.03 
 
 		 218 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0519385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 275 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 219 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 217 aa  263  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 222 aa  262  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  58.54 
 
 		 268 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  58.57 
 
 		 226 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 222 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  53.65 
 
 		 275 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  58.37 
 
 		 229 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  56.46 
 
 		 226 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 292 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 211 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 272 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 221 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 262 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0191  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 240 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.339095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  55.5 
 
 		 210 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 278 aa  257  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 210 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 260 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  57.97 
 
 		 325 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 211 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 210 aa  256  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29680  SSU ribosomal protein S3P  53.69 
 
 		 276 aa  255  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.778759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 210 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 302 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 211 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 219 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  56.8 
 
 		 279 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  53.33 
 
 		 224 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 219 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3156  30S ribosomal protein S3  55.83 
 
 		 254 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 223 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 224 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 211 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 224 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 233 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 210 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4501  ribosomal protein S3  57.49 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  57.41 
 
 		 258 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 224 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  57 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 217 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 217 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 249 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  53.99 
 
 		 217 aa  249  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0593  ribosomal protein S3  53.66 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.122908  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  54.38 
 
 		 223 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0633  ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 279 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 228 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 228 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 222 aa  248  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  52.54 
 
 		 277 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  54.81 
 
 		 223 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  54.93 
 
 		 223 aa  246  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 228 aa  246  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 228 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  54.33 
 
 		 244 aa  246  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  52.88 
 
 		 237 aa  245  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 227 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>