More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1342 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  60 
 
 
95 aa  118  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  57.14 
 
 
98 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  53.33 
 
 
93 aa  97.4  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  50 
 
 
95 aa  96.7  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  52.33 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  48.91 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 
98 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  55.79 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
94 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  49.48 
 
 
100 aa  90.1  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 
97 aa  87.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 
99 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 
98 aa  87  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  43.62 
 
 
96 aa  87  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 
99 aa  85.9  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  50.56 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  45.36 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  47.31 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
101 aa  84.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
95 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
98 aa  83.6  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  48.45 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  47.47 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  46.74 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  50.59 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  47.78 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  45.56 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  47.83 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  43.48 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0479  Ribosomal protein L25/L23  41.3 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  44.04 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  44.09 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  39.18 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  40.86 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  37.23 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  43.96 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  43.68 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  41.94 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  41.57 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  44.05 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  37.23 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  44.05 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  44.05 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.606959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>