More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1224 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  41.57 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  36.95 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  31.64 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  36.9 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.97 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.53 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  29.36 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  24.22 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 267 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 290 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.32 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  27.18 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  36.31 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  38.92 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  22.95 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  21.34 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24.42 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.03 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  34.39 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.88 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  23.83 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  25.44 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.48 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  26.46 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  27.45 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.33 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  24.82 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.48 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  45 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.35 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  24.53 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  24.34 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.23 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0847  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>