217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1214 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  47.62 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.66 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  37.31 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  45 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4084  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0692551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  30.95 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  30.66 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.62 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  32.67 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  33.98 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  33.8 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  33.8 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  33.8 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  32.1 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.51 
 
 		 177 aa  50.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.39 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  31.11 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.39 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  31.17 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  29.23 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  34.83 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>