More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1209 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
118 aa  219  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  57.02 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  59.48 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 
117 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  58.56 
 
 
115 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  53.45 
 
 
126 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  52.1 
 
 
117 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  59.21 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  30.43 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  37.23 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  37.23 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  28.95 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  48.1 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.63 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  45.88 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  40.96 
 
 
305 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 
554 aa  64.3  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  38.27 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  47.3 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  38.96 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  40.43 
 
 
254 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  32.99 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 
247 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
496 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
122 aa  60.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  29.91 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  35.34 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  24.37 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 
243 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  43.86 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  37.39 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
547 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
304 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 
123 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  30.25 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0208  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
466 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  45.71 
 
 
245 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  44.16 
 
 
500 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3628  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.11 
 
 
472 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4705  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.11 
 
 
472 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798058 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>