222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1189 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  100 
 
 
263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  60.47 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  57.79 
 
 
264 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  57.53 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  50.58 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  54.62 
 
 
267 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  51.14 
 
 
267 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  56.23 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  46.92 
 
 
254 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  41.04 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  41.09 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  41.02 
 
 
254 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 
268 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  43.25 
 
 
272 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  42.41 
 
 
256 aa  188  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 
253 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  41.41 
 
 
253 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  42.98 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 
248 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  37.7 
 
 
249 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  37.3 
 
 
249 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  37.7 
 
 
249 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  37.3 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  37.3 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  37.3 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  37.7 
 
 
249 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 
254 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 
249 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  40 
 
 
253 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  35.55 
 
 
271 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  36.51 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 
274 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 
261 aa  164  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  36.11 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  41.31 
 
 
257 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  37.7 
 
 
247 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  32.64 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.51 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.44 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.39 
 
 
269 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 
277 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
285 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 
284 aa  101  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
290 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
272 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.57 
 
 
257 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
286 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 
271 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 
269 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 
266 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 
269 aa  98.6  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 
285 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  30 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.14 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 
300 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
282 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
282 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
282 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.76 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.28 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 
281 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 
278 aa  89  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  30 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4188  hypothetical protein  45.87 
 
 
214 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00904545  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.67 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  32.14 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.53 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.83 
 
 
265 aa  82  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.97 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>