More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1088 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  67.67 
 
 
447 aa  641    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  70.56 
 
 
450 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  69.18 
 
 
448 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  100 
 
 
443 aa  917    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  71.14 
 
 
445 aa  666    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  67.76 
 
 
447 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  72.9 
 
 
447 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  67.91 
 
 
455 aa  631  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  69.88 
 
 
455 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  65.89 
 
 
447 aa  628  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  66.59 
 
 
447 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  64.73 
 
 
447 aa  618  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  66.43 
 
 
427 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3488  citrate synthase I  66.59 
 
 
428 aa  597  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3738  citrate synthase I  65.26 
 
 
428 aa  596  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.680995  normal  0.033422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  62.59 
 
 
436 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0581  citrate synthase I  65.96 
 
 
428 aa  588  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  64.94 
 
 
422 aa  569  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  55.07 
 
 
433 aa  494  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  55.71 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  55.5 
 
 
433 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  55.43 
 
 
432 aa  491  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  55.48 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  54.65 
 
 
434 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  54.39 
 
 
430 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  54.87 
 
 
430 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  54.73 
 
 
434 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  53.32 
 
 
435 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  55.05 
 
 
428 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  52.29 
 
 
434 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  52.76 
 
 
434 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  54.98 
 
 
430 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  53.7 
 
 
428 aa  481  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  53.24 
 
 
434 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  58.82 
 
 
429 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  56.78 
 
 
429 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  52.53 
 
 
433 aa  482  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  59.34 
 
 
427 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  55.26 
 
 
436 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  55.48 
 
 
430 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  55 
 
 
429 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  53.47 
 
 
434 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  54.63 
 
 
429 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  53.08 
 
 
438 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  52.09 
 
 
431 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  59.08 
 
 
427 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  53.92 
 
 
432 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  51.89 
 
 
439 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  54.65 
 
 
433 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  54.61 
 
 
442 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  53.94 
 
 
429 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  53.68 
 
 
429 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  54.63 
 
 
430 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  53.99 
 
 
429 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  51.38 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  53.72 
 
 
433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  52.31 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  53.79 
 
 
431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  54.2 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  57.44 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  53.97 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  53 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  53.26 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  57.44 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  57.44 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  50.92 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  57.44 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  57.69 
 
 
428 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  55.05 
 
 
428 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  53.37 
 
 
429 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  55.05 
 
 
428 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  53.72 
 
 
428 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  51.95 
 
 
446 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  51.72 
 
 
429 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  53.12 
 
 
429 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  53.02 
 
 
433 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  55.05 
 
 
428 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  54.59 
 
 
427 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  55.05 
 
 
428 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  52.79 
 
 
433 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  54.33 
 
 
430 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  55.5 
 
 
437 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  51.95 
 
 
429 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  54.33 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  57.51 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  52.4 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  53.02 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  52.38 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  53.26 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  53.26 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  53.48 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  53.26 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  56.68 
 
 
463 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  53.26 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  51.71 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  56.15 
 
 
428 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  53.35 
 
 
436 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  53.26 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  53.26 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  56.99 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>