More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1068 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  50.95 
 
 
265 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  49.62 
 
 
265 aa  228  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  44.4 
 
 
293 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  46.24 
 
 
289 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  43.86 
 
 
282 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  45.77 
 
 
255 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  47.53 
 
 
264 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  45.31 
 
 
262 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  44.53 
 
 
259 aa  202  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  45.66 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  44.91 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  43.63 
 
 
255 aa  198  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  47.67 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  47.67 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  46.99 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  44.15 
 
 
255 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 
281 aa  195  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  45.66 
 
 
263 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  44.32 
 
 
261 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 
262 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  45.32 
 
 
264 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  43.82 
 
 
266 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  44.83 
 
 
258 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  40.77 
 
 
277 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  42.34 
 
 
272 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  44.36 
 
 
264 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  43.94 
 
 
266 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  43.68 
 
 
275 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  41.06 
 
 
270 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  43.49 
 
 
291 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  41.92 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  42.05 
 
 
264 aa  188  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  42.7 
 
 
272 aa  188  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  42.8 
 
 
255 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  42.38 
 
 
269 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  42.38 
 
 
269 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 
264 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  41 
 
 
254 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  41.6 
 
 
257 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 
263 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 
258 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  42.21 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 
256 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  42.15 
 
 
256 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 
264 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 
264 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  39.77 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  39.03 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  38.78 
 
 
262 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  45.53 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  41.85 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  41.85 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 
258 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 
258 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 
275 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 
258 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  41.85 
 
 
267 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 
258 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 
258 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  45.14 
 
 
264 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 
258 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  42.38 
 
 
269 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 
322 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  37.35 
 
 
259 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 
258 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  41.92 
 
 
254 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  42.16 
 
 
294 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.44 
 
 
258 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  38.28 
 
 
255 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.44 
 
 
258 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 
271 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  39.06 
 
 
264 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  43.08 
 
 
254 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  36.23 
 
 
262 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 
266 aa  175  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  40.91 
 
 
260 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 
258 aa  174  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  39.93 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  41.6 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  39.3 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  40.31 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  39.38 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  39.02 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  39.41 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  35.74 
 
 
263 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  40.61 
 
 
272 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  34.7 
 
 
281 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.89 
 
 
254 aa  171  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.77 
 
 
256 aa  171  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  37.31 
 
 
261 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  37.69 
 
 
265 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40.68 
 
 
271 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  37.69 
 
 
265 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  40.61 
 
 
256 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.663777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>