More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1028 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  100 
 
 
368 aa  705    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1888  alanine racemase  53.87 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  41.87 
 
 
373 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  39.25 
 
 
387 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  38.98 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  39.67 
 
 
373 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  40.64 
 
 
371 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  37 
 
 
391 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  50.95 
 
 
365 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  36.73 
 
 
391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  36.73 
 
 
391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  34.79 
 
 
373 aa  235  9e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  37 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  37 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  36.46 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  36.46 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37.87 
 
 
391 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  36.19 
 
 
391 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  35.34 
 
 
373 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  36.46 
 
 
391 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  35.54 
 
 
379 aa  229  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  40.05 
 
 
384 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  38.34 
 
 
370 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  42.39 
 
 
369 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  41.42 
 
 
851 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  34.52 
 
 
373 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  36.24 
 
 
389 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  38.68 
 
 
389 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  38.68 
 
 
389 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  38.68 
 
 
389 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  38.68 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.83 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  38.68 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  38.95 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  39.21 
 
 
389 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  38.68 
 
 
389 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.07 
 
 
380 aa  225  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  38.68 
 
 
389 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  39.32 
 
 
390 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.58 
 
 
395 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  38.42 
 
 
389 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  39.04 
 
 
377 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  39.78 
 
 
398 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  36.29 
 
 
392 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  39.74 
 
 
441 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  38.89 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  35.58 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  39.41 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  37.43 
 
 
367 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  39.27 
 
 
375 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  34.51 
 
 
390 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  34.32 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  37 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.58 
 
 
386 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  35.64 
 
 
403 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  37 
 
 
364 aa  215  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.04 
 
 
395 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  34.32 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  36.63 
 
 
403 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.15 
 
 
388 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  37.53 
 
 
387 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  36.53 
 
 
379 aa  210  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  37.3 
 
 
402 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  34.05 
 
 
389 aa  209  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  34.84 
 
 
399 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  43.27 
 
 
380 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  39.11 
 
 
390 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  34.05 
 
 
399 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.56 
 
 
403 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.43 
 
 
364 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  33.42 
 
 
399 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  40.22 
 
 
376 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  38.38 
 
 
384 aa  205  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  39.51 
 
 
372 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  41.08 
 
 
380 aa  203  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  36.15 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  35.45 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  43.01 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  34.91 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  40.57 
 
 
397 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  33.16 
 
 
399 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  36.22 
 
 
434 aa  199  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  36.93 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  36.36 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  37.04 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  40.05 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  42.12 
 
 
811 aa  195  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  41.1 
 
 
395 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  40.55 
 
 
395 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  34.77 
 
 
382 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  39.73 
 
 
388 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  34.77 
 
 
382 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  36.76 
 
 
367 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  32.7 
 
 
382 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  38.07 
 
 
376 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  42.66 
 
 
378 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  33.24 
 
 
374 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  38.17 
 
 
380 aa  192  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  44.84 
 
 
849 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  35.92 
 
 
380 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>