More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0988 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  48.15 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  38.04 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.51 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 242 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.58 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  38.06 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1545  GntR domain-containing protein  34.16 
 
 		 176 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 263 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 268 aa  85.1  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 243 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  32.28 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>