More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0940 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  100 
 
 		 239 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  32.42 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  34.71 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  30.91 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  34.58 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  36.14 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.04 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  33.83 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  28.5 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  28.5 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  28.5 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  31.73 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  35.65 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.94 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.6 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  28.38 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  29.91 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31.08 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  30.62 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  32.34 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  31.48 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31.74 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 257 aa  85.1  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.47 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.78 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  29.24 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  27.06 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.44 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.79 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.2 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.87 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.5 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  29.39 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  31.65 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.25 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  27.8 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  31.19 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  32.07 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>