30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0901 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  100 
 
 
158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  51.39 
 
 
178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.67 
 
 
160 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  41.18 
 
 
162 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  40.29 
 
 
156 aa  97.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  42.36 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  43.57 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  39.72 
 
 
160 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  41.67 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  38.13 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  43.61 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  43.61 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  43.61 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  40.31 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  37.96 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  38.73 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  29.53 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  37.24 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  33.1 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  33.12 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  33.12 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  35 
 
 
158 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  33.86 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  30.5 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  34.09 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  31.45 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  37.27 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>