More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0804 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
145 aa  289  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  57.46 
 
 
150 aa  137  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  55.91 
 
 
164 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  54.03 
 
 
164 aa  135  3e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  55.07 
 
 
141 aa  133  7e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  51.15 
 
 
150 aa  130  4e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  56.92 
 
 
144 aa  127  4e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  50.74 
 
 
146 aa  127  5e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  50.74 
 
 
146 aa  127  5e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  50.74 
 
 
146 aa  127  5e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  54.62 
 
 
150 aa  125  2e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  54.62 
 
 
150 aa  125  2e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  54.62 
 
 
150 aa  125  2e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  55.08 
 
 
147 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  52.42 
 
 
144 aa  124  4e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
147 aa  124  4e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  53.49 
 
 
147 aa  124  4e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  52.76 
 
 
139 aa  124  4e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  50.85 
 
 
149 aa  123  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  54.89 
 
 
145 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  54.84 
 
 
153 aa  122  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  50.81 
 
 
148 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  52.89 
 
 
140 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  50.85 
 
 
147 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  50.37 
 
 
156 aa  120  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  55.65 
 
 
157 aa  119  1e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  48.74 
 
 
151 aa  118  2e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  48.95 
 
 
176 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 
160 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  50.38 
 
 
182 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  51.49 
 
 
154 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  51.69 
 
 
155 aa  117  4e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  52.03 
 
 
156 aa  117  4e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  47.76 
 
 
143 aa  117  8e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  49.15 
 
 
153 aa  115  2e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  50.79 
 
 
168 aa  115  2e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  51.28 
 
 
148 aa  115  2e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.33249e-05  hitchhiker  1.48724e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  50.79 
 
 
168 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  53.57 
 
 
144 aa  113  9e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  44.7 
 
 
156 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  49.6 
 
 
168 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
144 aa  110  7e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  49.55 
 
 
147 aa  110  8e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  50.88 
 
 
142 aa  109  2e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  49.62 
 
 
148 aa  109  2e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  50.89 
 
 
148 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  50 
 
 
150 aa  107  7e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 
158 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  51.33 
 
 
134 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
168 aa  96.7  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  34.33 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  56.57 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 
306 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  43.36 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
204 aa  84  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
513 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
299 aa  83.6  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
299 aa  83.2  1e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
316 aa  82.8  1e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
299 aa  80.9  5e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  43.64 
 
 
250 aa  80.9  5e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 
265 aa  80.9  6e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
154 aa  80.1  9e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 
304 aa  79.7  1e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 
290 aa  80.1  1e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0296  transcriptional regulator  29.52 
 
 
135 aa  79.7  1e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00196972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
300 aa  79  2e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
303 aa  79.3  2e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 
309 aa  78.6  2e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  45.65 
 
 
292 aa  79  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  47.92 
 
 
281 aa  79  2e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  3.76127e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  44.79 
 
 
261 aa  79  2e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
353 aa  79.3  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
328 aa  78.6  2e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  43.01 
 
 
291 aa  79  2e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  44.33 
 
 
255 aa  78.6  3e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 
296 aa  78.2  3e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 
301 aa  77.4  7e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 
291 aa  77  9e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
286 aa  77  9e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  36.75 
 
 
304 aa  76.6  1e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 
278 aa  76.6  1e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 
305 aa  76.6  1e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  43.01 
 
 
291 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
307 aa  75.5  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36 
 
 
286 aa  75.9  2e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  41.24 
 
 
297 aa  75.1  3e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 
296 aa  75.1  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 
292 aa  75.5  3e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 
300 aa  74.7  4e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 
288 aa  74.7  4e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
303 aa  74.3  5e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
311 aa  74.3  5e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
291 aa  74.3  6e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
339 aa  73.6  8e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
311 aa  73.6  8e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
311 aa  73.6  8e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 
331 aa  73.6  9e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>