More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0576 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
533 aa  1077    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  40.54 
 
 
516 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  37.08 
 
 
524 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  37 
 
 
517 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 
513 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 
513 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  34.48 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
537 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.77 
 
 
538 aa  210  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 
538 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.53 
 
 
537 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
520 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  28.6 
 
 
545 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 
537 aa  200  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  32.15 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.43 
 
 
545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 
517 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
525 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
536 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.84 
 
 
535 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
535 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 
517 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
539 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 
536 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  28.33 
 
 
527 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
515 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 
529 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 
529 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 
540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
519 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
527 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
519 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.72 
 
 
535 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
535 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
535 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 
511 aa  177  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  30.23 
 
 
514 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 
513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.51 
 
 
510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
529 aa  173  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
529 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
527 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.55 
 
 
526 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
527 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
527 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  27.75 
 
 
527 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  27.75 
 
 
527 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
536 aa  170  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 
512 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
526 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 
522 aa  160  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
509 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
534 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
523 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
561 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.34 
 
 
534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.26 
 
 
516 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
534 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.83 
 
 
554 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 
554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 
538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
512 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
512 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
512 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
510 aa  143  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
510 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 
522 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31 
 
 
531 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
519 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 
538 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 
532 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.88 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.88 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.05 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.98 
 
 
521 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.34 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.34 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.34 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.59 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.5 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.75 
 
 
528 aa  131  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
511 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.3 
 
 
528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.3 
 
 
528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.39 
 
 
528 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
550 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.39 
 
 
529 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3387  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 
550 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
509 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
538 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>