81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0540 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  100 
 
 
1061 aa  2065    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 
913 aa  271  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  32.41 
 
 
1424 aa  162  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  32.63 
 
 
1428 aa  148  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0957  OmpA/MotB domain protein  47.76 
 
 
716 aa  118  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0225193  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.57 
 
 
1332 aa  108  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.22 
 
 
767 aa  102  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  30.05 
 
 
665 aa  101  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  29.37 
 
 
659 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.65 
 
 
759 aa  94  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.24 
 
 
1762 aa  86.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  38.78 
 
 
3227 aa  85.9  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  30.25 
 
 
655 aa  85.5  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  30.14 
 
 
601 aa  78.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.95 
 
 
541 aa  77.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  30.23 
 
 
3562 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  27.11 
 
 
545 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.55 
 
 
4106 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  26.58 
 
 
3325 aa  72  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  30.68 
 
 
593 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  28.46 
 
 
1278 aa  68.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29 
 
 
575 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  27.1 
 
 
546 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  26.79 
 
 
558 aa  62.4  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2584  hypothetical protein  35.52 
 
 
793 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  27.75 
 
 
591 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  39.09 
 
 
3824 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  39.09 
 
 
3739 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  39.09 
 
 
3824 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  30.2 
 
 
3736 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  27.49 
 
 
591 aa  58.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  31.02 
 
 
575 aa  58.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  47.62 
 
 
837 aa  58.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30.75 
 
 
2704 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  28.8 
 
 
518 aa  58.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.52 
 
 
3824 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.33 
 
 
692 aa  56.6  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.52 
 
 
3721 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  28.33 
 
 
1825 aa  56.2  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  36.67 
 
 
978 aa  55.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  37.59 
 
 
2042 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  27.81 
 
 
530 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.01 
 
 
3586 aa  55.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  28.52 
 
 
3734 aa  55.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.32 
 
 
2192 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.59 
 
 
5216 aa  53.5  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  28.46 
 
 
572 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.46 
 
 
3552 aa  53.5  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  36.05 
 
 
562 aa  52.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  24.32 
 
 
2552 aa  52.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  28.32 
 
 
817 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  27.85 
 
 
1902 aa  52  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  28.57 
 
 
1439 aa  52  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5090  hypothetical protein  38.55 
 
 
467 aa  52  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.14 
 
 
2839 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  25.71 
 
 
4874 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  27.03 
 
 
647 aa  50.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  25.55 
 
 
3066 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3358  hypothetical protein  31.43 
 
 
743 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0199152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  29.06 
 
 
461 aa  49.7  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  32.67 
 
 
459 aa  49.7  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  31.61 
 
 
870 aa  49.7  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0418  hypothetical protein  23.12 
 
 
670 aa  49.3  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  28.95 
 
 
786 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.8 
 
 
593 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  25.85 
 
 
731 aa  48.5  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.94 
 
 
5743 aa  48.5  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  27.98 
 
 
516 aa  47  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  29.11 
 
 
2160 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  27.57 
 
 
4430 aa  47.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  42.55 
 
 
6109 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.43 
 
 
2927 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  23.81 
 
 
1106 aa  46.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  28.89 
 
 
526 aa  46.2  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  29.25 
 
 
717 aa  45.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  32 
 
 
422 aa  45.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.99 
 
 
4480 aa  45.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  40 
 
 
4672 aa  45.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  34.69 
 
 
5561 aa  44.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  34.69 
 
 
5561 aa  44.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  29.89 
 
 
1234 aa  44.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>